股东设立公司时，不仅依法制定公司章程，而且还会签订股东协议，这是公司成立过程中的两个基础法律文件，二者的内容往往有很多重合之处。就公司和股东而言，公司章程和股东协议都是非常重要的法律文件，然而公司正式设立时只需要向公司登记机关提交公司章程即可，于是，公司章程与股东协议之间的关系就成了有争议的问题，很多案件都是为公司章程与股东协议表述不一致而引发，那么这两者具有怎样的关系呢？可以从以下四个方面进行理解：

第一、公司章程与股东协议要保持一致性，若公司设立之前股东签订了股东协议，应在法律允许的范围内将股东协议的内容落实到公司章程中去。

第二、私密设置股份有限公司的章程是必须对外披露的，然而有些股东不愿意对外透露的内容，各个股东可以将该部分内容签订在股东协议中去。

第三、权限的划分，股份股东签署的设计股权激励、股权转让、股权回购的协议同样有效，但由于股东对外转让股权时，现有股东具有优先购买权，（有限公司为了限制外部人员进入公司成为股东）因此凡是涉及公司章程以外的第三人成为公司股东时，都需要公司至少半数以上股东同意或放弃优先购买权，否则可能签订了股权转让协议，但股权变更登记时障碍重重。

第四、增强覆盖公司章程的效力仅限于公司范围内和相关当事人，二股东协议可以实现更为灵活的安排，比如无需变更登记，随时协商变更，不仅适用于公司股东之间，也使用于股东与公司、股东与非股东之间、可以通过变通的方式对干股、技术股、期权、股权回购进行有效安排，可以约定违约责任。

建议：大部分公司使用的是公司登记机关的范本制式公司章程，三页左右，相当多的内容根本没有在章程中体现，股东之间发生相关纠纷，解决不了只能去法院通过诉讼解决，但碍于无证据支撑，很多股东从朋友变成了仇人，即便一方胜诉，公司也因此导致僵局迟滞发展，有的希望融资的，投资人经过尽调发现股东诉讼，便弃之不投，因此将股东之间的细节问题，尽可能详细约定明确，从而降低违规行为的发生。